Ehdotuksen tiedot

Tunnus:prEN ISO 23418
Julkaisija:CEN
Komitea:CEN/TC 463
Komitean nimi:Microbiology of the food chain
Lausuntokierros alkanut:2020-09-20
Lausuntopyynnön määräaika:2020-11-19
Vastuuhenkilö:kati.heiskanen(at)sfs.fi
Ehdotuksen soveltamisala:This international standard specifies minimum requirements for generating and analyzing whole-genome sequence (WGS) data obtained from foodborne bacteria. These requirements are applicable to any sequencing platform or chemistry. This process may include the following stages:• Handling of bacterial cultures;• Genomic DNA isolation;• Sequencing library preparation, sequencing, and assessment of raw DNA sequence read quality and storage;• Bioinformatic analysis, including methods such as high quality single nucleotide polymorphism (hqSNP)analysis, core genome and whole genome multi-locus genotyping (cgMLST, wgMLST), and bioinformatic pipeline validation; and• Metadata capture and sequence repository deposition.

Rekisteröidyttyäsi Lausuntopyyntöpalvelun käyttäjäksi voit lukea standardiehdotuksia ja kommentoida niiden sisältöä.

Kun haluat kommentoida lukemaasi tekstiä, valitse Lue ehdotus ja anna muutosehdotuksesi kohdassa Jätä kommentti.

Voit myös kertoa mielipiteesi standardiehdotuksesta kokonaisuutena. Ota kantaa siihen, hyväksytkö standardiehdotuksen vahvistamisen standardiksi.